1992—2000 年，1992 年上半年去澳大利亞氣候研究中心訪問工作，并向國內(nèi)國家氣候中心提供了當年的全國汛期預報書面意見，1993—2000 年 一直主持中國氣象科學研究院的汛期預報服務(wù)專家組工作。上世紀 90 年代長江流域及江南地區(qū)持續(xù)性多雨，陳菊英的預報大多取得了成功。特別是在 1996—1998 年，中國氣象科學研究院對全國汛期旱澇趨勢預報由陳菊英親自提供和參加全國會商會，其中在 1996 年至 1998 年的三年中，在全國 8 個參加提供全國汛期預報的大單位（國家氣候中心、水利部氣象信息預報中心、中國氣象科學研究院、中科院大氣物理研究所、中科院地理研究所、北京大學、總參氣象局、南京信息工程學院等）的統(tǒng)一評分中，本人為中國氣象科學研究院贏得了兩個一。特別是對 1998 年長江流域的特大洪水，本人在當年 1 月 25 日的中國氣象局專家組討論會上就提出來當年長江流域可能有接近 1954 年的特大洪水，希望提前發(fā)布重大天氣報告，加強防洪減災準備。后來這個預測意見被十年世界減災委采納后，有關(guān)部門提前到江西、湖南兩省江西了防洪演習。陳菊英這個預報意見在全國（100 多人參加）汛期預報會商會上和國家氣象局的各種重大天氣會商會上多次發(fā)言和強調(diào)，實況證明陳菊英預報與實際雨情和水情特別接近。當年中國因為提前對長江流域的特大洪水進行了，大程度地減少了特大洪水帶來的生命和財產(chǎn)損失，而獲得了世界氣象組織（WMO）頒發(fā)的防洪減災一等獎。十年世界減災委也給中國氣象科學研究院發(fā)了書面信，信中表揚了陳菊英提前準確預測了長江流域嚴重洪水的信。陳菊英也獲得了全國科技界抗洪救災先進個人。